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Valera Amador, Lazara
Esteve Sánchez, Mª Consuelo (dir.); García López, María Dolores (dir.) Universitat de València - MICROBIOLOGIA I ECOLOGIA |
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Aquest document és un/a tesi, creat/da en: 2007 | |
RESUMEN
El género Aeromonas con una amplia distribución en medios acuáticos, principalmente dulciacuícolas, incluye bacilos Gram negativos, oxidasa-positivos, heterótrofos y anaerobios facultativos. Su identificación durante las últimas décadas ha sido muy controvertida entre otros por la aparente incoherencia que se ha apreciado entre genotipo y genotipo que ha originado que los términos fenospecie y genospecie se usen como categorías independientes en la clasificación de la cepas de Aeromonas móviles. Este trabajo estudia extensamente las especies móviles y mesófilas, descritas en el género Aeromonas, utilizando la caracterización fenotìpica y el análisis numérico de los perfiles fenotípicos presentes en las cepas, además del estudio genotípico mediante hibridación DNA-DNA.
Hemos obtenido que la taxonomía fenotípica es una buena herramienta para delimitar e identificar las especies ...
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RESUMEN
El género Aeromonas con una amplia distribución en medios acuáticos, principalmente dulciacuícolas, incluye bacilos Gram negativos, oxidasa-positivos, heterótrofos y anaerobios facultativos. Su identificación durante las últimas décadas ha sido muy controvertida entre otros por la aparente incoherencia que se ha apreciado entre genotipo y genotipo que ha originado que los términos fenospecie y genospecie se usen como categorías independientes en la clasificación de la cepas de Aeromonas móviles. Este trabajo estudia extensamente las especies móviles y mesófilas, descritas en el género Aeromonas, utilizando la caracterización fenotìpica y el análisis numérico de los perfiles fenotípicos presentes en las cepas, además del estudio genotípico mediante hibridación DNA-DNA.
Hemos obtenido que la taxonomía fenotípica es una buena herramienta para delimitar e identificar las especies de Aeromonas móviles, por la excelente correlación entre los grupos definidos según nuestra metodología y los datos genotípicos y filogenéticos disponibles para dichas cepas como es el caso de A. jandaei, A. sobria, A. ichthiosmia, A. allosaccharophila, A. trota, A. hydrophila, A.caviae, A. encheleia, A. eucrenophila, A. media, A. schubertii y A. salmonicida. Proponemos una tabla de diagnóstico para la diferenciación de la mayoría de las especies de Aeromonas descritas, basada en 35 pruebas bioquímicas, entre las que destacan por su valor resolutivo, las siguientes: producción de H2S a partir de cisteína, oxidación de gluconato, ácido de celobiosa y glicerol, y utilización de L-serina y de L-lactato. El estudio de taxonomía numérica fenotípica realizado y los experimentos de hibridación DNA-DNA efectuados utilizando como referencia, entre otras, la cepa tipo de la especie A. jandaei han confirmado la existencia en este taxón de cepas de origen ambiental y de ámbito veterinario, las cuales presentan la capacidad de producir ácido a partir de sacarosa, aspectos todos ellos novedosos en cuanto a la descripción original de la especie A. jandaei. Se propone la enmienda de la descripción original de la especie A. jandaei efectuada por Carnahan y col. en el año 1992, para así incluir estas cepas sacarosa-positivas en dicha especie. En la descripción enmendada destacan, por ser recogidos por primera vez, la composición en bases guanina-citosina del DNA de la especie A. jandaei la cual oscila entre 58,1-61,1mol%.
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SUMMARY
The genus Aeromonas comprises Gram-negative, oxidase- and catalase-positive, heterotrophic, non-halophilic and facultative anaerobic bacilli which are widely distributed in natural waters. There is strong evidence for the role of Aeromonas as aetiological agents of a variety of systemic and localized diseases in poiquilothermic animals for the species A. salmonicida, A. hydrophila and A. jandaei. Moreover, during the last 15 years Aeromonas has been increasingly recognized as a primary, opportunist disease agent in humans, and at least six new Aeromonas species were originally isolated from clinical samples.
This study was undertaken to cluster and identify a large collection of Aeromonas strains. Numerical taxonomy was used to analyze phenotypic data obtained on 54 new isolates from different sources 99 type and reference strains. Each was tested for 121 characters but only the data for 71 were analyzed using the SSM and SJ coefficients, and the UPGMA clustering algorithm. At SJ values of ≥ 81.6% the strains clustered into 22 phenons which were identified as A. jandaei, A. veronii biogroup veronii, A. sobria, A. ichthiosmia, A. allosaccharophila, A. trota, A. hydrophila, A.caviae, A. encheleia, A. eucrenophila, A. media, A. schubertii y A. salmonicida. A good correlation was generally observed among this phenotypic clustering and previous genomic and phylogenetic data. Three new phenotypic groups were found which may correspond to new Aeromonas species or biotypes.
DNA relatedness between strains grouped in the A. jandaei cluster and A. jandaei CECT 4228T ranged from 70 to 100 %, but was below 50 % when DNAs from A. veronii biogroup sobria CECT 4835, A. veronii biogroup veronii CECT 4257T and A. ichthiosmia CECT 4486T were used. In addition, DNA relatedness between peripheral A. veronii biogroup sobria strains and the species A. jandaei (CECT 4228T), A. veronii (CECT 4257T, CECT 4835) and A. ichthiosmia (CECT 4486T) was always below 54 %, as it was between the species A. ichthiosmia (CECT 4486T) and A. veronii (CECT 4257T, CECT 4835). Emendation of A. jandaei is proposed; this taxon now includes sucrose-positive clinical and environmental strains as well as environmental isolates that are pathogenic for fish and humans.
The DNA G+C content of A. jandaei is also reported for the first time; it ranges from 581 to 611 mol%. The DNA relatedness data support the classification of peripheral reference strains of A. veronii biogroup sobria outside this taxon, indicating that biogroup sobria requires further revision.
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