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Giussani, Angelo
Merchán Bonete, Manuela (dir.); Serrano Andrés, Luis (dir.); Roca Sanjuán, Daniel (dir.) Departament de Química Física |
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Aquest document és un/a tesi, creat/da en: 2014 | |
La presente tesis se enmarca dentro de las líneas de investigación
del grupo QCEXVAL, y en particular en el estudio de la fotofísica y
fotoquímica de cromóforos de interés biológico. A continuación, se
van a resumir los resultados obtenidos en los cinco trabajos publicados
y presentados en esta tesis: la fotofísica de la molécula
1-aminonaftaleno, la fotofísica del cromóforo indol, el mecanismo
fotoinducido de formación del fotodímero (6-4) timina-timina, el
estudio y descripción crítica de la principal vía de decaimiento noradiativo
en la citosina, y la respuesta del herbicida asulam frente a
la radiación UVA y UVB.
1-aminonaftaleno
La optimización del estado fundamental converge a una estructura
en la cual el grupo amino está fuera del plano descrito por
los anillos aromáticos. En dicha geometría los primeros estados excitados
singlete corresponden a los estados 1(L...
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La presente tesis se enmarca dentro de las líneas de investigación
del grupo QCEXVAL, y en particular en el estudio de la fotofísica y
fotoquímica de cromóforos de interés biológico. A continuación, se
van a resumir los resultados obtenidos en los cinco trabajos publicados
y presentados en esta tesis: la fotofísica de la molécula
1-aminonaftaleno, la fotofísica del cromóforo indol, el mecanismo
fotoinducido de formación del fotodímero (6-4) timina-timina, el
estudio y descripción crítica de la principal vía de decaimiento noradiativo
en la citosina, y la respuesta del herbicida asulam frente a
la radiación UVA y UVB.
1-aminonaftaleno
La optimización del estado fundamental converge a una estructura
en la cual el grupo amino está fuera del plano descrito por
los anillos aromáticos. En dicha geometría los primeros estados excitados
singlete corresponden a los estados 1(Lb) y 1(La),
situados a 3.80 y 4.35 eV, respectivamente, desde el mínimo del estado
fundamental. La fuerza de oscilador asociada a la transición
al estado 1(La) es dos veces el orden de magnitud de la calculada
para la transición al estado 1(Lb). Como consecuencia
de ello, el estado 1(La) resulta ser el estado más brillante del
sistema. Con el fin de estudiar la evolución del sistema una vez excitado,
se ha determinado el camino de mínima energía en el estado
1(La) partiendo de la geometría de Franck-Condon. El análisis
de los resultados correspondientes nos permite concluir que el
estado 1(La) puede evolucionar a lo largo de un camino sin barrera
hacia una región de intersección cónica con el estado 1(Lb),
llegando ###finalmente a una región de mínimo. La presencia de dicha
región de degeneración hace suponer que parte de la población del
estado 1(La) pueda pasar al estado 1(Lb). No obstante, los
datos experimentales obtenidos en la escala de los femtosegundos
no detectaron tal transición. Desde la geometría de cruce, el estado
1(Lb) puede evolucionar a una estructura de mínimo. Los
orígenes de banda de los estados 1(La) y 1(Lb) se evalúan
en 3.69 y 3.50 eV, respectivamente. La producción de emisión no
es el único mecanismo de desactivación operativo en la molécula de
1-aminonaftaleno. De hecho, una intersección cónica entre el estado
1(La) y el estado fundamental ha sido encontrada, la cual puede
mediar un proceso de conversión interna hacia el estado fundamental.
Dicha geometría se caracteriza por una distorsión localizada en
el doble enlace C2 = C3, el cual experimenta una torsión típica de
las llamadas cónicas de tipo eteno. La región de degeneración está
situada a 0.7 eV con respecto al mínimo del estado 1(La). Su
importancia en la fotoquímica del sistema queda por tanto ligada
a la energía en exceso proporcionada. Dicha circunstancia explica
los resultados experimentales obtenidos en la escala de picosegundos,
los cuales registran un tiempo de vida media que disminuye al
aumentar la energía de la radiación de excitación. Al aumentar la
energía proporcionada al sistema, se favorece la posibilidad de alcanzar
la región de intersección cónica con el estado fundamental y
como consecuencia el tiempo de vida medio del estado excitado será
menor.
Indol, la principal fuente de emisión en las proteínas
Se ha realizado un estudio exhaustivo de los posibles procesos inducidos
en la molécula de indol como consecuencia de la interacción con
radiación UV. A la geometría optimizada para el estado fundamental,
los dos estados excitado singlete más bajos han resultado ser,
utilizando la nomenclatura de Platt, 1(Lb) y 1(La). Dichos
estados están situados verticalmente a 4.36 y 4.79 eV, respectivamente,
desde el mínimo del estado fundamental. El cálculo de la
fuerza de oscilador para las respectivas transiciones electrónicas nos
ha permitido identificar el 1(La) como el estado excitado más
brillante. De todas formas, la diferencia de fuerza de oscilador para
las transiciones hacia los estados 1(La) y 1(Lb) no es tan
grande como para excluir la posibilidad de que el estado 1(Lb)
sea poblado directamente. El cálculo del camino de mínima energía
en el estado 1(La) nos ha permitido estudiar la evolución del
sistema. Dicho estado alcanza una región de intersección cónica con
el estado 1(Lb) y, por tanto, parte de la población del primer
estado excitado puede pasar al estado 1(Lb). Este último evoluciona
hacia una estructura de mínimo, desde la cual se produce la
fluorescencia típica del sistema indol. El origen de banda calculado
para el estado 1(Lb) es igual a 4.11 eV. Esta misma región de
equilibrio ha sido determinada por medio del cálculo del camino de
mínima energía en el estado 1(Lb) desde la geometría Franck-
Condon. Dicho resultado corrobora la importancia de la estructura
de mínimo del estado 1(Lb) para el proceso de fluorescencia en
el indol. En función de la energía de excitación dada a la molécula,
otros mecanismos de desactivación también pueden ser activados.
De hecho, un proceso no-radiativo estrictamente relacionado con el
exceso de energía presente en el sistema, mediado por una
intersección cónica entre el estado 1(Lb ) y el estado fundamental situada
a 0.4 eV respecto al mínimo del estado 1(Lb), también ha sido
caracterizado. La presencia de dicha barrera energética explica la
fuerte disminución del rendimiento de fluorescencia observada experimentalmente
al aumentar la energía de excitación.
Aducto Timina-Timina (6-4), una fotolesión del ADN
En este estudio se ha determinado un posible mecanismo de formación
del aducto timina-timina (6-4). Como modelo se ha utilizado un
sistema compuesto por dos moléculas de timina posicionadas en la
geometría en la que se encuentran en una misma hebra de B-ADN. El
mecanismo obtenido describe un posible camino de reacción a partir
de la absorción de radiación por el sistema hasta la formación del
intermedio oxetano. En dicha orientación, los estados excitados singlete
más brillantes son los correspondientes a dos moléculas de timina
aisladas y, por tanto, describen excitaciones localizada cada
una en el doble enlace carbono-carbono de una nucleobase. La clave
para que el proceso fotoquímico tenga lugar ha sido identificada en
la población de los estados 1-3np localizados en el grupo carbonilo
reactivo, los cuales evolucionan a una estructura de mínimo caracterizada
por un fuerte alargamiento del enlace carbono-oxígeno.
Dichos estados np pueden ser poblados a lo largo del camino
principal de decaimiento descrito por el estado brillante 1pp de la
correspondiente nucleobase. Debido a la distorsión presente en la
geometría de mínimo np, el oxígeno originalmente constituyente
el grupo carbonilo se encuentra enlazado a la molécula por un enlace
doble debilitado y, como consecuencia, puede reaccionar más
fácilmente con el doble enlace carbono-carbono de otra nucleobase
timina. Dicha reacción tiene lugar a través del estado de triplete
más bajo el cual puede ser poblado debido a la presencia
de un región de degeneración entre los estados 3ppy 1-3np, accesible
desde el mínimo de los estados 1-3np. El estado 3pp puede
sucesivamente evolucionar hacia una región de degeneración con el
estado fundamental, a lo largo de un camino en la correspondiente
superficie de energía potencial en el cual los dos monómeros se van
acercando, estando ya parcialmente enlazados en la geometría
de cruce. A partir de dicha región de degeneración, el estado
fundamental así poblado puede evolucionar hacia la estructura oxetano,
cuya formación constituye la parte fotoinducida del mecanismo
global de producción del aducto timina-timina (6-4). El punto de
partida del mecanismo presentado lo constituye la población de los
estados 1-3np desde el estado brillante 1pp a lo largo de su camino
de desactivación. Dicha característica permite que la radiación absorbida
sea disipada eficazmente de forma no radiativa. Por tanto,
el mecanismo de formación aquí descrito, tiene lugar a partir de una
situación en la cual la mayoría de la población del estado brillante
decae hacia el estado fundamental. Este hecho puede explicar el
bajo rendimiento cuántico de formación de dicho producto.
Citosina, un cromóforo del ADN
En el contexto de la tesis doctoral, se ha realizado el cálculo de
camino de mínima energía a nivel CASPT2//CASPT2 del estado
brillante de la molecula citosina a partir de una geometría de
mínimo del estado fundamental previamente publicada. En el espacio
activo han sido considerados todos los orbitales de tipo p de la
molécula. El conjunto de base ANO-L contraída según el esquema
O,C,N [4s,3p,1d]/ H[2s1p] ha sido empleado, utilizando dos estados
en el proceso de optimización de los orbitales (state averaging ). Dicho
estudio ha sido realizado empleando el programa MOLCAS 7.6.
Según los resultados obtenidos, el camino de mínima energía que
caracteriza el estado excitado brillante lleva a una geometría de
mínimo.
Asulam, un pesticida ampliamente utilizado
A la geometría optimizada del estado fundamental, los estados excitados
singlete más bajos en energía son los denominados 1(Lb) y
1(La ), y están situados a 4.36 y 5.02 eV, respectivamente. Siendo
la fuerza de oscilador asociada a la transición al estado 1(La )
dos veces el orden de magnitud que la correspondiente al estado
1(Lb), el estado 1(La ) puede ser considerado el más brillante.
El camino de mínima energía en el estado 1(La ) desde la
geometría de Franck-Condon lleva a través de un camino sin barreras
a una región de intersección cónica entre el estado 1(La ) y
el estado fundamental. De esta forma, a través de un proceso de conversión interna,
el estado fundamental puede volver a la geometría
de equilibrio de partida. Sin embargo, a lo largo del mecanismo
principal de desactivación descrito, otros procesos pueden tener lugar
debido a la presencia de varios cruces entre estados tanto singlete
como triplete. Una intersección cónica con el estado 1(Lb)
ha sido de hecho identificada, la cual determina que parte de la
población del estado 1(La) pase al estado 1(Lb). Este último,
puede evolucionar hacia una estructura de mínimo, desde donde se
produce la fluorescencia típica del sistema. Cuatro estados triplete
se cruzan a lo largo del camino de mínima energía descrito por el
estado 1(La). Una vez poblados, decaen a través de diferentes
mecanismos de conversión interna al mínimo del estado triplete más
bajo de naturaleza. Desde esta región, el sistema puede además
evolucionar hacia una región accesible de cruce con el estado fundamental.
La presencia de esta última contribuye a la fotoestabilidad
de la molécula de asulam.
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