An investigation on the fauna of metazoan parasites of the striped red mullet, Mullus surmuletus, in the Spanish Mediterranean has been carried out. It represents the most detailed parasitological study of this species in this region to date. Our research focuses on the advantages and limitations of the use of parasites as population tags, and as a tool to trace the origin (spatial and temporal) of captures of striped red mullet. The main goal is to provide useful, yet critical evidence to achieve a sustainable management of this overexploited fish species. Overall, we analyzed 1024 fish during the period 2003-2006: 1000 fish were collected from 5 localities of the Spanish Mediterranean (from north to south: Barcelona, Burriana, Santa Pola, Roquetas de Mar and Fuengirola), and 100 from 2 Tusinian localities, i.e., Sfax y Zarzis. In addition, a total of 104 fish was also collected for validation of predictive models, including fish from other localities from Mediterranean (Palamós, Peñíscola, Valencia) and Atlantic (Barbate) localities, as well as fish from the 5 main Spanish localities of the study that were larger or smaller than those used to build the predictive models. This thesis is divided into 3 main sections: 1. A taxonomic section, in which parasite taxa are identified and described in detail, or eventually classified as new species. This long section is necessary to reliably perform research on parasites as biological tags. 2. An ecological (biogeographical) section in which diversity patterns of parasites from striped red mullets are examined at a large geographical scale (the whole Mediterranean Sea). This analysis allows a better understanding of the processes that generate patterns of diversity (e.g., species’ turnover) and abundance at smaller spatial scales. 3. A section about the use of parasites as biological tags, in which we firstly investigate the validity of some implicit assumptions usually adopted in studies about the use of parasites to discriminate stocks and traceability of fish. Then, we investigate the use of parasites for both stock discrimination and traceability in the case of red-striped mullet at several spatial scales and between different seasons.En el presente trabajo se ha realizado un estudio de la fauna de metazoos parásitos del salmonete de roca, Mullus surmuletus, en el Mediterráneo español. Se trata del estudio más detallado y completo hasta la fecha sobre los parásitos de este teleósteo en esta región. Además, en este trabajo investigamos las ventajas y limitaciones del uso de los parásitos como marcadores poblacionales y como herramientas para trazar el origen de las capturas de salmonete de roca con el fin de ayudar a gestionar y manejar esta especie que actualmente se encuentra sobreexplotada. Para ello se analizaron 1204 peces durante el período 2003-2006: 1000 procedentes de 5 puertos del Mediterráneo español (de norte a sur: Barcelona, Burriana, Santa Pola, Roquetas de Mar y Fuengirola) y 100 de 2 localidades de la costa tunecina (de norte a sur: Sfax y Zarzis); además, para realizar pruebas de validación se muestrearon 104 individuos de otras localidades de la costa española (de norte a sur: Palamós, Peñíscola, Valencia), incluyendo una localidad del Océano Atlántico (Barbate), así como peces de las 5 localidades principales del estudio, pero cuyo tamaño corporal se encontraba fuera del rango de los 1000 seleccionados para el estudio principal. Esta tesis se divide en 3 grandes apartados: 1. Un apartado taxonómico, donde se describe en detalle o se clasifica la parasitofauna encontrada. Este extenso apartado se justifica porque, para investigar el uso de los parásitos como marcadores, se necesita primero identificar de forma crítica, o eventualmente clasificar, las especies de parásitos hasta el nivel taxonómico más bajo posible. 2. Un apartado ecológico (biogeográfico), donde se examinan patrones de diversidad parasitaria del salmonete a gran escala geográfica (todo el Mediterráneo), que sirven de base para comprender la variación espacial a escalas más pequeñas. De este modo se puede entender mejor los procesos que generan diferencias de diversidad y sustitución (turnover) de especies de parásitos, lo que ayuda a definir más críticamente el uso de éstos como marcadores. 3. Un apartado de uso de parásitos como marcadores, donde se investiga la validez de los principios en que se basa el uso habitual de los parásitos en la identificación y discriminación de stocks y en la trazabilidad pesquera a meso y microescala. Este procedimiento se aplica a la especie de objeto de estudio con el fin de, conociendo mejor la biología del salmonete de roca, poder ofrecer información valiosa para el control y manejo sostenible de la pesquería de este teleósteo.