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Understanding the mechanisms of DNA/RNA damage induced by
UV light and under the conditions of reductive stress was the main
objective of this Thesis. The complete-active-space self-consistent field/complete-active-space second-order perturbation theory (CASSCF/CASPT2) method and accurate
reaction-path computational strategies have been employed in nucleobase
monomers and dimers for such purposes. Regarding the DNA/RNA
damage induced by UV light, we have studied the photoproduction of
cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) in pi-stacked nucleobases, which can take place via the singlet or triplet manifolds. These photodimerization mechanisms are initiated by the absorption of light by a single pyrimidine, which occurs initially into a singlet excited state. After this localized excitation event, evolution towards dimer production can take place in those arrangements between two adjacent pyrimidines that have an effective pi-stacking interaction. Hence, key structures in the mechanism of CPD formation are the bioexcimers, which were characterized for cytosine, thymine, and uracil. On the other hand, triplet
population in the isolated nucleobases is also possible along the main
decay channel of the bright state. Then, excimer formation between the triplet state and a pi-stacked nucleobase in its ground state may also give rise to the CPDs. Finally, regarding DNA/RNA damage by ionization processes, the dissociation electron-attachment (DEA) mechanism of uracil caused by low energy electrons was determined.La comprensión de los mecanismos de daño en el DNA/RNA inducidos por luz UV y en condiciones de estrés reductor fue el principal objetivo de esta tesis. Para ello se usaron en monómeros y dímeros el método espacio activo complete campo autoconsistente / espacio activo completo teoría de perturbaciones hasta segundo orden de espacio activo complete(CASSCF/CASPT2) y estrategias computacionales precisas de determinación del camino de reacción. En cuanto al
daño inducido por la luz UV en el ADN/ARN, hemos estudiado la fotoproducción de
dímeros de pirimidina ciclobutano (CPDs) en nucleobases apiladas a través de las vías singlet y triplete. Estos mecanismos de fotodimerización son iniciados por la absorción de luz en una pirimidina, en un estado excitado singlete. Después de este evento de excitación localizada, la evolución hacia la producción dímero puede tener lugar en dos pirimidinas adyacentes que presenten una interacción efectiva por apilamiento de tipo pi. Por lo tanto, las estructuras clave en el mecanismo de formación de CPD son los bioexcimers, que se caracterizaron pora la citosina, timina y uracilo. Por otro lado, la población del triplete en las nucleobases aisladas también es posible a lo largo del principal canal de desactivación del estado brillante. Entonces, la formación de excímero entre el estado triplete y una base nitrogenada adyacente en su estado fundamental también puede dar lugar a los CPDs. Finalmente, en relación daños al DNA/RNA causados por procesos de ionización, se determinó el mecanismo de disociación por adición de electrones de baja energía en el uracilo.
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