NAGIOS: RODERIC FUNCIONANDO

Development of molecular approaches for direct detection and quantification of wine-related microorganisms

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Development of molecular approaches for direct detection and quantification of wine-related microorganisms

dc.contributor.advisor	Ferrer Soler, Sergi
dc.contributor.advisor	Pardo Cubillos, Isabel
dc.contributor.author	Soares dos Santos, Verónica
dc.contributor.other	Departament de Microbiologia i Ecologia	es_ES
dc.date.accessioned	2018-02-14T11:53:08Z
dc.date.available	2019-02-15T05:45:05Z
dc.date.issued	2018	es_ES
dc.date.submitted	09-02-2018	es_ES
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10550/64703
dc.description.abstract	En esta tesis doctoral se han desarrollado procedimientos para la detección y cuantificación de levaduras y bacterias acéticas totales y, en concreto, de las especies más importantes en la vinificación como Saccharomyces cerevisiae, Brettanomyces bruxellensis, Zygosaccharomyces bailii, L. plantarum, y O. oeni. Las estrategias que se han utilizado para el desarrollo de nuevos métodos se centran fundamentalmente en la supresión del paso de extracción previa de ADN y de los procedimientos de eliminación de inhibidores de la reacción de PCR presentes en las muestras. Para llevar a cabo este objetivo general, se establecieron los siguientes objetivos específicos; 1, desarrollo de un método de qPCR que permita la detección y la cuantificación de células enteras de microorganismos del vino, independientemente de si éstas están en un estado viable o no; 2, desarrollo de un método de qPCR que permita la detección y cuantificación de células viables de microorganismos del vino, para lo cual se requiere el tratamiento previo con propidio de monoazida (PMA) de las células presentes en una muestra; 3, desarrollo de un método basado en la técnica loop-mediated isothermal amplification (LAMP) para la detección de células enteras de microorganismos del vino, independientemente de si éstas están en un estado viable o no; 4, desarrollo de un método LAMP cuantitativo para la detección y cuantificación de células enteras de microorganismos del vino, independientemente de si éstas están en un estado viable o no. Los procedimientos desarrollados permiten realizar la detección y cuantificación de las células enteras de esos grupos microbianos o de las especies concretas sin necesidad de recurrir a la extracción del DNA y directamente a partir de mostos, de vinos o de medios de cultivo. Además, la matriz de la cual provengan las células (medios de cultivo, mostos o vinos, tanto blancos como tintos) no inhibe las reacciones de PCR y LAMP. Ello es particularmente importante en el caso de los vinos tintos, donde se encuentran polifenoles y etanol, descritos frecuentemente como inhibidores de las polimerasas. Los límites de detección y cuantificación, y las eficiencias obtenidas en mostos y vinos fueron similares a los obtenidos en medio de cultivo. Los métodos desarrollados permiten la detección y cuantificación de células (tanto totales como vivas y muertas) en un plazo de tiempo que varía entre 1 y 5 horas. Estos procedimientos se han aplicado para la detección y cuantificación de levaduras y bacterias de mostos y vinos producidos industrialmente.	es_ES
dc.format.extent	209 p.	es_ES
dc.language.iso	en	es_ES
dc.subject	qPCR	es_ES
dc.subject	LAMP	es_ES
dc.subject	wine	es_ES
dc.subject	lactic acid bacteria	es_ES
dc.subject	yeasts	es_ES
dc.subject	acetic acid bacteria	es_ES
dc.subject	molecular approaches	es_ES
dc.title	Development of molecular approaches for direct detection and quantification of wine-related microorganisms	es_ES
dc.type	doctoral thesis	es_ES
dc.subject.unesco	UNESCO::CIENCIAS DE LA VIDA	es_ES
dc.embargo.terms	1 year	es_ES