Among the parasitic infections that affect the humanity, the intestinal helminthiasis stand out for their great morbidity, as currently over 2000 million of persons are affected and they caused important economic loses related with livestock and veterinary. Echinostoma caproni is an intestinal trematode that, due to its characteristics, is used in numerous studies as experimental model to investigate the factors related with the resolution of acute infections or the development of chronic infections caused by intestinal helminths. In this work we have analyzed the differential expression of proteins during a first infection, after the pharmacological treatment, and during the reinfection for E. caproni in ICR mice, a host where the parasite develops a chronic infection. The proteins extracts of mice’s intestines were analyzed by 2D-DIGE to determinate their differential expression, and the most significant were identified by mass spectrometry. 38 proteins in total were identified. Most of them belonged to energetic metabolism, were antioxidants or were related with the intestinal epithelial restauration. Our results indicate that the changes in these processes can be related with the establishment of chronic infection caused by intestinal helminths.Entre las enfermedades parasitarias que afectan a la humanidad, las helmintiasis intestinales destacan por su gran morbilidad, ya que actualmente afectan a más de 2000 millones de personas y causan grandes pérdidas económicas relacionadas con la ganadería y la veterinaria. Echinostoma caproni es un trematodo intestinal que, por sus características, es utilizado en numerosos estudios como modelo experimental para determinar los factores por los que se resuelve una infección aguda o se desarrolla una infección crónica causada por helmintos intestinales. En este trabajo se analizó la expresión diferencial de proteínas durante una primoinfección, después de un tratamiento farmacológico y durante una reinfección por E. caproni en el intestino de ratones ICR, hospedadores en los que el parasito desarrolla infecciones crónicas. Las proteínas extraídas del intestino de los ratones se analizaron mediante 2D-DIGE para determinar su expresión diferencial, y aquellas más significativas fueron identificadas mediante espectrofotometría de masas. Se identificaron un total de 38 proteínas, de las cuales la mayoría pertenecían al metabolismo energético, eran antioxidantes o estaban relacionadas con la restauración del epitelio intestinal. Nuestros resultados indican que los cambios que se producen en estos procesos pueden estar relacionados con el establecimiento de infecciones crónicas por helmintos intestinales.