El estudio para el diagnóstico de la discinesia ciliar primaria (DCP) tradicionalmente incluye, entre otras pruebas diagnósticas, la evaluación ultraestructural de los axonemas ciliares mediante microscopía electrónica de transmisión (MET). Sin embargo, la identificación de variantes genéticas de DCP con ultraestructura conservada o de cambios sutiles, junto con el desarrollo de nuevas modalidades de diagnóstico para la DCP que permiten la evaluación estructural de los cilios, como el análisis de inmunofluorescencia y una mayor disponibilidad de pruebas genéticas, hace que se cuestione el papel contemporáneo de la MET en el diagnóstico de la DCP. Por otra parte, los estudios de correlación fenotipo ciliar-genotipo-fenotipo clínico permiten ampliar el conocimiento de la fisiopatología de esta entidad. El objetivo de esta tesis reside, por una parte, en poner en valor el papel de la MET como método diagnóstico de la DCP, y por otra identificar posibles asociaciones entre los defectos ultraestructurales axonemales, la movilidad ciliar y el genotipo respecto al fenotipo clínico de pacientes con DCP. Nuestro análisis electronomicroscópico axonemal se enmarca dentro de un estudio unicéntrico, observacional, de carácter prospectivo y retrospectivo llevado a cabo sobre una serie de 117 pacientes reclutados entre 2018 y 2021, en el que la observación minuciosa ultraestructural de repetidas secciones ciliares se ha correlacionado con las manifestaciones clínicas presentes en los pacientes, con los datos obtenidos en el examen de la movilidad ciliar y así mismo con los resultados del estudio genético practicado en estos mismos pacientes. El estudio llevado a cabo nos ha proporcionado la obtención de una amplia base de datos y resultados, que en su análisis nos ha permitido identificar un nuevo defecto axonemal, presente en todos los pacientes DCP, y que previamente no aparece descrito en la literatura. Los resultados de este estudio señalan el defecto en los brazos de dineína como la alteración axonemal más prevalente en nuestra serie de pacientes DCP, destacando el DNAH5 como el gen más frecuentemente afectado. Por otra parte, los estudios de correlación que llevamos a cabo confirmaron la existencia de ciertas correlaciones entre fenotipo clínico-genotipo-fenotipo ciliar, si bien otras asociaciones aún deben ser bien definidas. El análisis ultraestructural detallado y exhaustivo que realizamos sobre las biopsias nasales resultó de gran utilidad para el reconocimiento e identificación de los cambios ciliares secundarios, alteraciones inespecíficas que suelen interferir en el correcto diagnóstico ultraestructural de esta entidad. Por último, consideramos que la disposición modificada de los dobletes periféricos detectada mediante MET en la totalidad de pacientes DCP de nuestro estudio, y a la que denominamos “rotura de simetría axonemal”, puede aportar otro punto de vista sobre la patogénesis subyacente a esta entidad, y proponemos sea introducida como un nuevo defecto ultraestructural a considerar en el diagnóstico de la DCP. Con todo ello, confirmamos la relevancia de la MET dentro del algoritmo diagnóstico de la DCP así como la necesidad de más estudios de correlación que permitan aumentar el conocimiento de esta entidad, y remarcamos las interesantes posibilidades que aún puede ofrecer el estudio morfológico ultraestructural de las muestras biópsicas en Patología.The study for the diagnosis of Primary Ciliary Dyskinesia (PCD) traditionally includes, among other diagnostic tests, ultrastructural evaluation of ciliary axonemes by transmission electron microscopy (TEM). However, the identification of genetic variants of PCD with preserved ultrastructure or subtle changes, together with the development of new diagnostic modalities for PCD that allow structural evaluation of cilia, such as immunofluorescence analysis and increased availability of genetic tests, raises questions about the contemporary role of TEM in the diagnosis of PCD. On the other hand, ciliary phenotypegenotype- clinical phenotype correlation studies allow to expand the knowledge of the pathophysiology of this entity. The aim of this thesis is, on the one hand, to highlight the role of TEM as a diagnostic method for PCD and, on the other hand, to identify possible associations between axonemal ultrastructural defects, ciliary motility and genotype with respect to the clinical phenotype of patients with PCD. Our axonemal electronomicroscopic analysis is part of a single-center, observational, prospective and retrospective study carried out on a series of 117 patients recruited between 2018 and 2021, in which the detailed ultrastructural observation of repeated ciliary sections has been correlated with the clinical manifestations present in the patients, with the data obtained in the examination of ciliary motility and also with the results of the genetic study performed in these same patients. The study carried out has provided us with an extensive database and results, which in its analysis has allowed us to identify a new axonemal defect, present in all DCP patients, and which has not been previously described in the literature. The results of this study point to the defect in the dynein arms as the most prevalent axonemal alteration in our series of PCD patients, highlighting DNAH5 as the most frequently affected gene. xvii On the other hand, the correlation studies we conducted confirmed the existence of certain clinical phenotype-genotype-ciliary phenotype correlations, although other associations have yet to be well defined. The detailed and exhaustive ultrastructural analysis we performed on nasal biopsies was very useful for the recognition and identification of secondary ciliary changes, nonspecific alterations that often interfere with the correct ultrastructural diagnosis of this entity. Finally, we consider that the modified arrangement of the peripheral doublets detected by TEM in all the PCD patients in our study, which we call "axonemal symmetry break", may provide another point of view on the pathogenesis underlying this entity, and we propose that it would be introduced as a new ultrastructural defect to be considered in the diagnosis of SCD. With all this, we confirm the relevance of TEM within the diagnostic algorithm of PCD as well as the need for more correlation studies to increase the knowledge of this entity, and we highlight the interesting possibilities that can still offer the ultrastructural morphological study of biopsy samples in Pathology.