NAGIOS: RODERIC FUNCIONANDO

A genomic view of mRNA turnover in yeast

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A genomic view of mRNA turnover in yeast

dc.contributor.author	Pérez Ortín, José Enrique
dc.contributor.author	Jordán Plá, Antonio
dc.contributor.author	Pelechano García, Vicente José
dc.date.accessioned	2013-12-04T11:37:47Z
dc.date.available	2013-12-04T11:37:47Z
dc.date.issued	2011
dc.identifier.citation	Pérez Ortín, José Enrique Jordán Pla, Antonio Pelechano García, Vicente José 2011 A genomic view of mRNA turnover in yeast Comptes Rendus Biologies 334 8-9 647 654
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10550/31730
dc.description.abstract	The steady-state mRNA level is the result of two opposing processes: transcription and degradation; both of which can provide important points to regulate gene expression. In the model organism yeast Saccharomyces cerevisiae, it is now possible to determine, at the genomic level, the transcription and degradation rates, as well as the mRNA amount, using DNA chip or parallel sequencing technologies. In this way, the contribution of both rates to individual and global gene expressions can be analysed. Here we review the techniques used for the genomic evaluation of the transcription and degradation rates developed for this yeast, and we discuss the integration of the data obtained to fully analyse the expression strategies used by yeast and other eukaryotic cells. Le taux de l"ARNm est maintenu à l"équilibre grâce à deux processus antagonistes : la transcription et la dégradation. Ces deux mécanismes sont cruciaux pour réguler l"expression des gènes. Dans l"organisme modèle Saccharomyces cerevisiae, il est maintenant possible de déterminer, au niveau génomique, les taux respectifs de transcription et de dégradation, ainsi que la quantité d"ARNm présente, en utilisant les puces à ADN ou le séquençage en parallèle. De cette manière, il est possible de connaître la contribution de chacun de ces processus en analysant le niveau d"expression des gènes individuellement et globalement. Nous présentons et comparons dans cet article les techniques utilisées pour évaluer les taux respectifs de transcription et de dégradation des transcrits de cette levure. Nous discutons la possibilité de l"utilisation des données obtenues pour analyser en profondeur les stratégies d"expression employées par la levure ainsi que par d"autres cellules eucaryotes. --------------------------------------------------------------------------------
dc.relation.ispartof	Comptes Rendus Biologies, 2011, vol. 334, num. 8-9, p. 647-654
dc.subject	Genòmica
dc.subject	Transcripció genètica
dc.subject	RNA
dc.subject	Saccharomyces cerevisiae
dc.title	A genomic view of mRNA turnover in yeast
dc.type	journal article	es_ES
dc.date.updated	2013-12-04T11:37:47Z
dc.identifier.doi	10.1016/j.crvi.2011.05.013
dc.identifier.idgrec	068060
dc.rights.accessRights	open access	es_ES