Dado que las empresas familiares son la mayoría, y que en Colombia existen pocos estudios empíricos en el tema, esta investigación pretende evaluar el impacto de las prácticas de recursos humanos en el desempeño organizativo, a través del efecto mediador de la innovación y el aprendizaje organizativo en empresas familiares vs no familiares. En el modelo se incluyen tres variables moderadoras; orientación emprendedora, orientación al mercado y turbulencia del entorno. A través de ecuaciones estructurales y con una muestra de 138 encuestas válidas, se obtiene que las relaciones evaluadas cambian entre empresas familiares y no familiares; las prácticas de recursos humanos impactan positivamente el desempeño organizativo de forma directa, con un efecto negativo cuando la relación es mediada por la innovación y positivo cuando es mediada por aprendizaje organizativo; y que la innovación tiene un efecto directo y positivo sobre el desempeño organizativo. Asimismo, se obtiene que la orientación emprendedora y la orientación de mercado impactan de forma significativa la relación entre aprendizaje organizativo e innovación, siendo esta última moderación negativa. Dentro de las implicaciones prácticas para las empresas de familia se recomienda enfocarse en prácticas de recursos humanos que faciliten el aprendizaje organizativo, por encima de la innovación; e incentivar el desarrollo de actividades de innovación que impacten el desempeño organizativo.