Objetivo Analizar de forma comparativa los costes indirectos y directos de dos técnicas mínimamente invasivas (litotricia extracorpórea (LEOC) vs ureterorrenoscopia-láser holmium (URS/RIRS)) para el tratamiento de la litiasis reno-ureteral menor de 2 cm. Material y métodos Estudio prospectivo y comparativo, no aleatorizado de 84 pacientes tratados por litiasis reno-ureteral menor de 2 cm entre enero y diciembre de 2016. De estos, 38 (45,67%) se trataron con LEOC (18 litiasis renales y 20 litiasis ureterales) y 46 (54,32%) con URS/RIRS (22 litiasis renal y 24 litiasis ureteral). Un total de 19 (41,3%) pacientes estaban activos laboralmente en el grupo de URS/RIRS y 15 (39,5%) pacientes en el grupo de LEOC. Las variables analizadas fueron sexo, edad, número y tamaño de las litiasis, días de baja laboral debido al tratamiento, estimación del coste indirecto por la pérdida de productividad laboral y el coste directo del tratamiento aplicado incluyendo el seguimiento (número total de procedimientos, procedimientos auxiliares, visitas y pruebas diagnósticas). Para la estimación del coste indirecto se empleó la Encuesta de Estructura Salarial 2015 (INE). Además también se utilizó el cuestionario "Work Productivity and Activity Impairment" (WPAI) para determinar el grado de percepción de pérdida de productividad. Resultados El número medio de sesiones hasta la resolución de la litiasis fue de 2,57 para el grupo de LEOC y de 1,04 para la URS. El promedio de días de baja laboral en el grupo de la URS fue de 7,16 días, mientras que en el caso de la LEOC fue de 3,18 (p = 0,034). Los costes indirectos totales derivados de la pérdida de productividad fueron de 621,55 euros y de 276,05 euros para la URS y LEOC respectivamente. Los costes directos en el grupo de la LEOC fueron de 1382,9 euros y 2317,71 euros en el grupo de la URS. El grado de afectación en el trabajo percibido por los pacientes sometidos a URS fue del 18,88% y del 21,33% en el grupo de LEOC. El grado de afectación para realizar actividades cotidianas fue del 24,44% en URS y del 15% en LEOC. Conclusiones la LEOC es una técnica que precisa de un mayor número medio de sesiones para la resolución de la litiasis reno-ureteral menor de 2 cm, pero con una menor repercusión en los costes totales y en la percepción del grado de afectación.